Пасля дэмабілізацыі, з 1920 жыў у [[Бабруйск]]у, з 1934 — у [[Мінск]]у. Пісаў музыку для [[Беларускае радыё|Беларускага радыё]], выкладаў у музычнай школе. Пасля Вялікай Айчыннай вайны Я. Цікоцкі кіраваў Беларускай філармоніяй, потым на працягу 13 год узначальваў Саюз кампазітараў БССР. Адзін з заснавальнікаў беларускай оперы і сімфоніі у [[БССР]]. У 1970-х, калі гарадскія ўлады руйнавалі гістарычны цэнтр Мінска, Я. Цікоцкі быў адным з актыўных абаронцаў архітэктурнай спадчыны. Бацька літаратуразнаўца [[М. Я. Цікоцкі|М. Я. Цікоцкага]].