У час свайго заснавання Франкфурцкі ўніверсітэт быў першым унівесітэтам Германіі, які поўнасцю фінансаваўся на прыватныя сродкі. Дзякуючы актыўнай падтрымцы Обербургамістраобербургамістра [[Франц Адзікес|Франца Адзікеса]], прамысоўцыпрамыслоўцы [[Вільгельм Мертан|Вільгельма Мертана]] і ахвяраванням грамадзян (было сабрана каля 14 мільёнаў залатых марак), у 1914 годзе кайзер [[Фрыдрых Вільгельм II]] дазволіў адкрыццё ўнівесітэтуўніверсітэту. У сваім першым зімнім семестры 1914/1915 унівесітэтуніверсітэт меў 50 прафесараў і 618 студэнтаў (з іх сто жанчын).
ПобачНароўні з Берлінскім унівесітэтам Франкфурцкі ўніверсітэт меў найлепшае фінансаванне сярод усіх універсітэтаў у Германіі. Тут было арганізавана сучаснае выкладанне, заснавальнікам было важна, каб ўу дадатак да традыцыйных прадметаў выкладалісьвыкладаліся новыя дысцыпліны практычнай накіраванасці. Прыродазнаўчыя дысцыпліны атрымалі адмысловы факультэт і не з'яўлялісьяўляліся, як гэта было звычайна ў той час, часткай філасофскага факультэту. Таксама тут былбыў адкрыты першы факультэт эканамічных і сацыяльных навук у Германіі. Шмат інстытутаў з'яўляліся часткай універсітэта, напрыклад, Інстытут сацыяльных даследаванняў, Акадэмія працы, Інстытут культурнай марфалогіі.
З 1932 года унівесітэтуніверсітэт носіць імя [[Гётэ]].
Неўзабаве пасля прыходу Гітлера да ўлады, нацысты выгналі ўсіх яўрэйскіх і палітычна неблаганадзейных навукоўцаў і студэнтаў з універсітэтаў. Франкфурцкі ўніверсітэт гэта кранула асабліва моцна: 100 яўрэйскіх навукоўцаў страцілі магчымасць выкладаць ўвесну 1933 года, траціне ўсіх прафесараў давялося пакінуць універсітэт. Яшчэ 16 выкладчыкаў былі звольнены па палітычных прычынах.
Пасля заканчэння Другой сусветнай вайны і аднаўлення разбураных будынкаў, унівестэтуніверстэт быў зноў адкрыты ў лютым 1946 г.
